Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms