Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 PIK3R3-201ENST00000262741 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHDC4-205ENST00000446344 4444 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 BTN3A2-209ENST00000527422 1460 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 WNT4-201ENST00000290167 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC85C-207ENST00000557769 3793 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 OLMALINC-201ENST00000454935 2551 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL359924.1-201ENST00000450451 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF16-202ENST00000394909 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 COL5A2-201ENST00000374866 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PLA2G4D-201ENST00000290472 3584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RIPOR1-202ENST00000379312 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL390728.1-201ENST00000397642 1941 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP89-201ENST00000305768 5678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC098850.4-201ENST00000448331 8802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NWD1-204ENST00000524140 7641 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RCVRN-201ENST00000226193 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 BAG5-203ENST00000445922 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH1-214ENST00000621016 3304 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR623-201ENST00000384986 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR596-201ENST00000385091 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLV3-25-201ENST00000390305 380 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP244-201ENST00000390936 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL080276.1-201ENST00000405959 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC018638.1-201ENST00000414464 330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RHOA-IT1-201ENST00000428083 517 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM231A-201ENST00000434336 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP2C58P-201ENST00000436281 475 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL365356.2-201ENST00000441526 196 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL133387.1-201ENST00000442188 382 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TXNP3-201ENST00000454560 301 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL357055.1-201ENST00000457967 410 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL754P-201ENST00000470784 266 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRE-207ENST00000471218 522 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TECRP1-201ENST00000513307 445 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms