Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCG2Q9UNQ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms