Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM10Q9UDY6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM10Q9UDY6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM10Q9UDY6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM10Q9UDY6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM10Q9UDY6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM10Q9UDY6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms