Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASXL3Q9C0F0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASXL3Q9C0F0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms