Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM55Q9BYV6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms