Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP58Q9BVL2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms