Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms