Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 MBD5-208ENST00000478804 592 ntTSL 52.45□□□□□ -2.022e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLAC1-203ENST00000473897 333 ntTSL 52.45□□□□□ -2.022e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SNX14-207ENST00000503491 3491 ntTSL 22.43□□□□□ -2.022e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CLEC2D-215ENST00000544322 389 ntTSL 1 (best)2.42□□□□□ -2.022e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 53.6
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TBRG4Q969Z0 SORBS1-220ENST00000634504 1847 ntTSL 214.45□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 53.6
TBRG4Q969Z0 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 53.6
TBRG4Q969Z0 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 53.6
TBRG4Q969Z0 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 53.6
TBRG4Q969Z0 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.18□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 53.6
TBRG4Q969Z0 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 53.6
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TBRG4Q969Z0 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 53.6
TBRG4Q969Z0 CHD6-209ENST00000482596 599 ntTSL 1 (best)5.96□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 53.6
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TBRG4Q969Z0 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 53.6
TBRG4Q969Z0 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 51.61□□□□□ -2.151e-6■■■■■ 53.6
TBRG4Q969Z0 RGS12-210ENST00000506631 1530 ntTSL 1 (best)23.85■■□□□ 1.411e-6■■■■■ 53.5
TBRG4Q969Z0 RGS12-224ENST00000514268 2751 ntTSL 518.8■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 53.5
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