Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms