Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms