Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP1Q86WV1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms