Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms