Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH4AQ5TD94 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms