Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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