Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC1A5Q15758 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC1A5Q15758 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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