Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CARM1-206ENST00000588947 468 ntTSL 528.11■■■□□ 2.094e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CARM1-208ENST00000590039 596 ntTSL 510.76□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CARM1-207ENST00000589693 601 ntTSL 510.24□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.282e-8■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 BRD4-209ENST00000601071 430 ntTSL 55.72□□□□□ -1.493e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.658e-12■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 FKBP2-206ENST00000541388 705 ntTSL 517.61■□□□□ 0.418e-12■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.068e-12■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.358e-12■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 IPO4-202ENST00000557996 530 ntTSL 414.87□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 IPO4-216ENST00000561034 535 ntTSL 413.37□□□□□ -0.273e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 IPO4-213ENST00000560315 558 ntTSL 212.67□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 COL27A1-208ENST00000494780 514 ntTSL 421.6■■□□□ 1.051e-8■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PUF60-218ENST00000531995 631 ntTSL 318.09■□□□□ 0.492e-11■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 HNRNPL-203ENST00000595164 2404 ntTSL 213.9□□□□□ -0.189e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 HNRNPL-206ENST00000597731 3094 ntTSL 210.86□□□□□ -0.679e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 AC008982.1-202ENST00000602021 342 ntTSL 57.44□□□□□ -1.229e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 COASY-209ENST00000588353 387 ntTSL 315.55■□□□□ 0.082e-14■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 AKT2-220ENST00000486647 457 ntTSL 313.92□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 FKBP2-204ENST00000535135 639 ntTSL 323.56■■□□□ 1.363e-12■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.895e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.675e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.645e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.445e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TSEN34-206ENST00000456872 853 ntTSL 223.96■■□□□ 1.435e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TSEN34-205ENST00000455798 956 ntTSL 223.83■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.371e-15■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TSEN34-207ENST00000496583 2372 ntTSL 223.45■■□□□ 1.355e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.245e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CDS2-202ENST00000450570 945 ntTSL 322.18■■□□□ 1.145e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CDS2-204ENST00000467923 783 ntTSL 322.12■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 DMTN-218ENST00000522148 616 ntTSL 521.82■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.045e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NELFE-211ENST00000492185 1786 ntTSL 220.56■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.875e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.875e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.832e-9■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NELFE-208ENST00000481121 1543 ntTSL 219.94■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NOP56-209ENST00000469588 950 ntTSL 219.53■□□□□ 0.725e-10■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.575e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 EFNA3-202ENST00000470294 763 ntTSL 318.63■□□□□ 0.575e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 ESPN-213ENST00000632803 455 ntTSL 318.34■□□□□ 0.532e-29■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 218.23■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT11-210ENST00000510641 1870 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PEF1-207ENST00000492061 936 ntTSL 318.21■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 ESPN-210ENST00000478323 270 ntTSL 518.18■□□□□ 0.52e-29■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TSPAN32-205ENST00000437313 734 ntTSL 518.07■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 ESPN-212ENST00000632593 506 ntTSL 218.04■□□□□ 0.482e-29■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 VARS2-202ENST00000421263 460 ntTSL 217.59■□□□□ 0.412e-25■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 DDX49-209ENST00000599373 772 ntTSL 317.54■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT11-205ENST00000504637 548 ntTSL 517.27■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 FASN-202ENST00000578424 951 ntTSL 217.24■□□□□ 0.352e-15■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MTSS1L-203ENST00000576338 518 ntTSL 317.21■□□□□ 0.353e-8■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 AC008575.2-203ENST00000512790 1850 ntTSL 217.14■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 RAC1-204ENST00000488373 845 ntTSL 1 (best)16.89■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 FASN-204ENST00000580382 681 ntTSL 316.72■□□□□ 0.272e-15■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 DDX49-210ENST00000599981 583 ntTSL 216.35■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCNL1-208ENST00000466101 911 ntTSL 216.3■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 216.29■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 216.27■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 METAP2-211ENST00000553151 564 ntTSL 516.19■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 DMTN-212ENST00000519333 579 ntTSL 416.17■□□□□ 0.181e-9■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TKT-213ENST00000487660 610 ntTSL 216.04■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CAD-208ENST00000479002 614 ntTSL 515.87■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 EBP-203ENST00000446158 714 ntTSL 515.48■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 515.42■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TKT-211ENST00000472528 1055 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 EBP-201ENST00000276096 904 ntTSL 214.88□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MCM3-206ENST00000596983 559 ntTSL 314.65□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PLEKHG4-208ENST00000562744 491 ntTSL 414.46□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PEF1-204ENST00000472443 687 ntTSL 314.41□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PEF1-206ENST00000489164 865 ntTSL 514.41□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-208ENST00000527226 613 ntTSL 214.35□□□□□ -0.111e-15■■■■■ 36.5
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1274.3 ms