Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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