Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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