Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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