Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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