Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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