Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms