Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms