Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP27A1Q02318 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms