Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME5P56597 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME5P56597 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME5P56597 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME5P56597 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME5P56597 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME5P56597 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME5P56597 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME5P56597 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME5P56597 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME5P56597 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME5P56597 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME5P56597 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME5P56597 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms