Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJC1P36383 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJC1P36383 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJC1P36383 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJC1P36383 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJC1P36383 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJC1P36383 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJC1P36383 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms