Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNA2P20248 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms