Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C6orf47O95873 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms