Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF3-202ENST00000338458 3639 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A4-201ENST00000317370 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NEK1-203ENST00000507142 5556 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF559-213ENST00000603380 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092145.1-201ENST00000564809 2434 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SIX1-201ENST00000247182 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PMS2-201ENST00000265849 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMEF12-201ENST00000357726 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SPECC1L-204ENST00000437398 6674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINA5-205ENST00000554276 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINA5-208ENST00000554866 2211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMEF7-201ENST00000330881 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD4A-201ENST00000367147 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMEF11-201ENST00000619922 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC111182.1-201ENST00000588701 3419 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP4-208ENST00000447335 2050 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GFM2-207ENST00000509430 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR3C-201ENST00000334163 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TCN2-203ENST00000407817 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms