Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 TTYH2-201ENST00000269346 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM52-205ENST00000611618 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 MAB21L3-201ENST00000369500 3229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 C4orf46-201ENST00000379205 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 EFCAB12-201ENST00000326085 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 AL359918.1-201ENST00000451892 2720 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 WDR81-201ENST00000309182 3808 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF180-211ENST00000592529 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 AL133216.2-201ENST00000622550 7213 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 APOL1-206ENST00000426053 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 CIITA-212ENST00000618207 2844 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 SCAMP1-207ENST00000621999 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 TRUB1-201ENST00000298746 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 SSUH2-201ENST00000317371 2561 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 GUCY1A3-208ENST00000511507 2552 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 AVL9-202ENST00000409301 4336 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 RCAN2-202ENST00000330430 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 JADE1-201ENST00000226319 5772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 TNPO1-213ENST00000523768 2632 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF438-206ENST00000442986 3245 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 WNT4-201ENST00000290167 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ILK-202ENST00000396751 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 FER1L4-208ENST00000611673 3860 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-2Q9BYR5 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.9 ms