Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SERP1Q9Y6X1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms