Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms