Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms