Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms