Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms