Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms