Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SHANK2-AS3Q9BTD1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SHANK2-AS3Q9BTD1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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