Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms