Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBXQ8WY36 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms