Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms