Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC2Q8N394 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC2Q8N394 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms