Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms