Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms