Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms