Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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COL5A1-AS1Q5SY13 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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COL5A1-AS1Q5SY13 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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COL5A1-AS1Q5SY13 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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COL5A1-AS1Q5SY13 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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COL5A1-AS1Q5SY13 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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