Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms