Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms