Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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