Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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